Índice

Projetos Científicos e Pesquisadores

Os Projetos de Pesquisa da UNESP que serão atendidos pelo GridUNESP são:

• Definição de Regiões Genômicas Críticas Envolvidas na Progressão, Resposta a Tratamento e Metástase em Tumores Humanos
• Dinâmica de Vórtices em Supercondutores de Alta Temperatura Crítica do Tipo II
• Estudo Mecânico Quântico de Processos Não Radiativos em Moléculas de Interesse Biológico
• Estudo Numérico de Sistemas de Eletrons Fortemente Correlacionados em Baixa Dimensionalidade
• Genoma Estrutural-Rede de Biologia Molecular Estrutural
• Implementação Otimizada de Algoritmos Estocásticos para Alinhamento Múltiplo de Seqüências em Clusters de Arquitetura Beowulf
• Simulações Numéricas de Larga Escala em Física
• Física de Altas Energias e HEP Grid
• UNESP-Gridgene
• Modelagem das Propriedades Elétricas de Cerâmicas Semicondutoras
• Aspectos Termodinâmicos no Processo de Enovelamento de Proteínas
• Modelagem Tridimensional de Dados Geológicos, Fisiográficos, Hidrográficos e Geo-ambientais
• Caracterização Teórica das Propriedades Elétricas e Catalizadoras de Óxidos
• Métodos Analíticos e Numéricos em Engenharia Mecânica
• Análise de Fluxo de Dados: Um Modelo para a Detecção de Ataques em Grids Computacionais e Redes de Alta Velocidade
• Caracterização de novos materiais para uso no desenvolvimento de nanomateriais e materiais de alto valor agregado
• Bioprospecção químico-farmacológica para obtenção de bioprodutos farmacêuticos, cosméticos e agroquímicos

A equipe completa de pesquisadores envolvidos no projeto pode ser encontrada aqui e maiores detalhes sobre cada um dos projetos científicos podem ser encontrados aqui.

Os projetos apresentados envolvem as seguintes instituições distribuídas:

• Instituto de Química, Araraquara
• Faculdade de Ciências, Laboratório de Simulação Molecular, Departamento de Matemática, Bauru
• Faculdade de Ciências, Departamento de Química, Bauru
• Faculdade de Ciências, Departamento de Física, Bauru
• Faculdade de Medicina de Botucatu, Departamento de Urologia, Botucatu
• Faculdade de Engenharia, Departamento de Engenharia Mecânica, Ilha Solteira.
• Instituto de Geociências e Ciências Exatas, Departamento de Física, Rio Claro
• Instituto de Geociências e Ciências Exatas, Departamento de Estatística Matemática Aplicada e Computação, Rio Claro
• Instituto de Geociências e Ciências Exatas, Departamento de Petrologia e Metalogenia, Rio Claro
• Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Departamento de Ciências da Computação e Estatística, São José do Rio Preto
• Instituto de Física Teórica, São Paulo

Cronograma de Execução

O Cronograma de execução do projeto do GridUNESP originalmente proposto à Finep pode ser encontrado aqui.

Organograma

A gerência do projeto é constituída pelas seguintes Coordenações:

Coordenação Científica

• Contato com os grupos de pesquisadores das unidades
• Contato com as iniciativas internacionais de Grid
• Estabelecimento dos objetivos estratégicos do GridUNESP

Coordenação Técnica

• Configuração do hardware
• Implantação e integração dos clusters

Coordenação de TI

• Contato com os pólos de informática das unidades
• Planejamento de rede
• Coordenação dos grupos de TI trabalhando em P&D em Grid
• Treinamento aos pesquisadores na utilização do cluster (submissão de jobs, etc)

Coordenação Administrativa

• Organização de reuniões e workshops
• Licitações e Compras
• Prestações de contas
• Relatórios do projeto

O Organograma do projeto do GridUNESP pode ser encontrado aqui.

Equipe Técnica

Uma descrição da equipe detalhada da equipe técnica do GridUNESP pode ser encontrada aqui.

Clusters e Distribuição Geográfica

Clusters

Os equipamentos referentes a cada cluster serão:

Tier 0

• 1 Servidor de Gerenciamento (4 GB RAM, 146 GB disco)
• 128 Nós de Processamento (2 GB RAM, 36 GB disco)
• 3 Servidores de Armazenamento (2 GB RAM, 36 GB disco)
• 6 Unidades de Armazenamento (6 X 4 TB, SCSI U320, Tecnologia RAID 5)
• 1 Switch Gerenciável Nível 2 (24 portas Gigabit RJ45 + 4 Gigabit fibra)
• 4 Switches Não gerenciável, Nível 2 (48 portas Gigabit RJ45)
• 19 Nobreaks (8 tomadas, 3kVA, 220 V)
• 5 Racks (19” de largura X 42 U’s de altura)

Tier 1

• Servidor Gerenciamento/Armazenamento (4 GB RAM, 146 GB)
• 16 Nós de Processamento(2 GB RAM, 36 GB disco)
• 1 Unidade de Armazenamento (4 TB, SCSI U320, Tecnologia RAID 5)
• 1 Switche Nível 2 (24 portas Gigabit RJ45 + 4 portas Gigabit fibra)
• 3 Nobreaks (8 tomadas, 3kVA, 220 V)
• 1 Racks (19” de largura x 42 U’s de altura)

Os esquemas dos racks podem ser vistos aqui.

Distribuição Geográfica

O mapa com a distribuição geográfica da Tier 0 e das Tiers 1 pode ser visto aqui.

Workshops

I Workshop - Bauru

O I Workshop do GridUNESP foi realizado em 24 de maio de 2004 no campus de Bauru. O programa deste workshop e as respectivas apresentações podem ser encontrados aqui.

II Workshop - Reitoria/São Paulo

O II Workshop do GridUNESP foi realizado em 6 de outubro de 2006 na Reitoria da UNESP. O programa do workshop foi:

Horário	Apresentador	Título
09h45	Dr. José Arana Varela	O ProINFRA e a GridUNESP
10h00	Dr. Sérgio F. Novaes	O Projeto GridUNESP: Integrando a Capacidade Computacional da UNESP
10h30	Dr. Antonio D. Rivera	Inovação na Arquitetura para a Computação do Futuro
11h00	Dr. Eduardo M. Gregores	Planejamento para a Implantação do GridUNESP
11h30	Dr. José Roberto Gimenez	Recursos de Conectividade para o GridUNESP
12h00	Discussão

III Workshop - IFT/São Paulo

O III Workshop do GridUNESP será realizado no dia 14 de dezembro de 2007 no Instituto de Física Teórica - IFT/UNESP. O workshop, "GridUNESP: Integração e Oportunidades de Pesquisa", tem por objetivo apresentar o status do projeto e discutir as próximas etapas de sua implementação. Além disto, aproveitaremos esta oportunidade para fazer um levantamento das necessidades de processamento e armazenamento, agora dando ênfase às características das tarefas que serão submetidos ao Grid, ou seja o perfil dos problemas a serem atacados e os softwares que são utilizados pelos diferentes grupos. (Organizadores: Ney Lemke e Aguinaldo Robinson de Souza)

Videoconferência

O Workshop deverá ser transmitido através do EVO: http://evo.caltech.edu/.

Programa do Workshop

Horário	Status Report do Projeto GridUNESP
09h30	Sérgio F. Novaes	Status do Projeto GridUNESP
10h10	Eduardo Gregores	O GridUNESP e as Iniciativas Internacionais de Grid
10h30	Ney Lemke	Infra-estrutura de Software do GridUNESP
10h50	José Roberto Gimenez	Infra-estrutura Física do GridUNESP
11h10	Rogério Iope	Programa de Treinamento e Formação de Recursos Humanos
11h30	Almoço
14h00	OSG Executive Board Meeting	Videoconferência
15h00	Apresentação dos Projetos de Pesquisa
15h00	Aguinaldo Robinson de Souza	Modelagem e Simulação Computacional em Materiais
15h15	Ney Lemke	Modelagem Computacional de Sistemas Biológicos
15h30	João Batista Aparecido	Simulação Numérica de Escoamentos Turbulentos
15h45	Coffee-Break
16h00	Gastão Krein	Simulações numéricas de campos quânticos na rede e transições de fase dinâmicas
16h15	Makoto Yoshida	Simulações numéicas do enovelamento de proteínas
16h30	Ivan Rizzo Guilherme	GridDEMAC: Redes Complexas e Aplicações em Filogenia, Meio Ambiente e Geociência
16h45	Pablo Venegas	Peaks in the Differential Resistance in Superconducting Films with Periodic Pinning Centers
17h00	André Malvezzi	Estudo numérico de sistemas de elétrons fortemente correlacionados em baixa dimensionalidade
17h15	Discussão Final
17h15	Ações Futuras

• OSG Executive Board Meeting
  • https://twiki.grid.iu.edu/twiki/bin/view/Deployment/20071214AgendaMinutes
  • http://indico.fnal.gov/conferenceDisplay.py?confId=1329

Kickoff Workshop

O Kickoff Workshop do GridUNESP será realizado no dia 11 de setembro de 2007. O workshop tem por objetivo a organização da equipe de profissionais que será responsável pela instalação, operação e manutenção da infra-estrutura do GridUNESP. Será discutido o organograma e a divisão de trabalho da equipe. Será feito um update do projeto e um planejamento para sua entrada em operação. Para mais detalhes ver Kickoff Workshop

Infra-estrutura para Instalação

Barra Funda

O andamento da infraestrutura da Barra Funda pode ser visto aqui.

Clusters Secundários: Requerimentos

Todos os gabinetes virão com um Modular Power Supply (MPS). Cada MPS exige um conector do tipo IEC 309 60AMP de 4 polos. As especificações utilizadas nos racks Sun pode ser encontrada aqui. No nosso caso será utilizado o RACK 1000-42 com MPS 60A 3-PHASE (última coluna).

Os conectores sugeriados são da STECK. Existe mais de uma opção, ams o importante é utilizar conectores que suportem amperagem de 60A, 220/240V, como por exemplo o modelo S-4559W de 63A e 220/240V. Para maiores detalhes ver: http://www.steck.com.br/brasil/shocktite.php. Atenção para a ligação nos contatos (cabeamento) de: área mínima de 10,0 mm2 e máxima de 16,0 mm2

Eletricidade	8,5 kW	trifásica, 3 X 25 A = 75 A, disjuntor próprio
Refrigeração	36.000 BTU/h	com redundância

Maiores detalhes sobre os clusters secundários pode ser obtidas aqui.

Levantamento da Infra-estrutura das Unidades do Interior

O Dr. José Roberto Gimenez, Coordenador de TI do GridUNESP, visitou todas as unidades do interior para levantar a infra-estrutura local para instalação dos clusters Tiers 1. Seu relatório, incluindo fotos dos locais, pode ser encontrado aqui.

Esse é o resumo da presente situação dos sites:

	Eletricidade	* Necessita a criação de um circuito dedicado ao cluster
Rio Claro	Refrigeração	* Instalação de equip. para incrementar a capacidade de refrigeração
	Rede	* Facilidade de conexão, porém necessita aquisição de equipamento
	Eletricidade	* Necessita a criação de um circuito dedicado ao cluster
Botucatu	Refrigeração	* Instalação de equip. para incrementar a capacidade de refrigeração
	Rede	* A unidade não dispõe de conexão com a rede KyaTera
	Eletricidade	* Necessita a criação de um circuito dedicado ao cluster
Araraquara	Refrigeração	* Instalação de equip. para incrementar a capacidade de refrigeração
	Rede	* Facilidade de conexão, porém necessita aquisição de equipamento
	Eletricidade	* Necessita a criação de um circuito dedicado ao cluster
Bauru	Refrigeração	* Instalação de equip. para incrementar a capacidade de refrigeração
	Rede	* A rede Kyatera chega em Bauru, porém não na unidade da UNESP.
	Eletricidade	* Necessita a criação de um circuito dedicado ao cluster
S.J. Rio Preto	Refrigeração	* Instalação de equip. para incrementar a capacidade de refrigeração
	Rede	* Facilidade de conexão, porém necessita aquisição de equipamento.
	Eletricidade	* Necessita a criação de um circuito dedicado ao cluster
I. Solteira	Refrigeração	* Instalação de equip. para incrementar a capacidade de refrigeração
	Rede	* A unidade não dispõe de conexão com a rede KyaTera

Reunião: Site Preparation: 10/Jul/2008

• Adriano: Ofício Circular da PROPE aos Diretores das Unidades dizendo que os equipamentos estão no Brasil e qual a infra-estrutura que deve ser implantada como contra-partida.
• João: IS não terá grandes problemas. Não foram informados: precisam do ofício. Especificar detalhes elétricos.
  • Já fez exposição na unidade sobre o projeto
  • Reuniu-se com o Vice-diretor recentemente: chamou reunião da CLI
  • Tudo está andando: não vê grandes problemas no horizonte
• Pablo
  • O diretor disse que a unidade vai bancar o for necessário.
• Ney: 30.000 BTU = R$ 2.200,00
• Elson:
  • Falar com Prof. Varela: Solicitar à FAPESP
• Enviar e-mail dia 4/Ago solicitando os dias preferidos para fazer a fone-conferência.
• Ofícios para
  • Bauru: Diretor Faculdade de Ciências - Prof. Dr. Henrique Luiz Monteiro - Faculdade de Ciências - UNESP - Campus de Bauru - Av. Eng. Luiz Edmundo Carrijo Coube, s/n - Vargem Limpa - Cep: 17033-360 - Bauru - SP

Diretor da unidade da Faculdade de Ciências Prof. Dr. Henrique Luiz Monteiro

• • São José do Rio Preto: Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto. Diretor: PROF. DR. CARLOS ROBERTO CERON
  • Ilha Solteira: Diretor da Unidade: Wilson Manzoli Júnior - Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira - Av. Brasil, 56 - 15.385-000 - Ilha Solteira - SP
  • Rio Claro: Diretor - Instituto de Geociências e Ciências Exatas - Prof. Dr. Sebastião Gomes de Carvalho
  • Botucatu: Profa. Dra. Maria de Lourdes M. V. Paulino - Presidente Grupo Administrativo do Câmpus de Botucatu, Campus de Botucatu - Unesp - Dist. Rubião Jr. s/n, Cep 18618-000 Botucatu - SP

• S-4559W.pdf: S-4559W.pdf